Новые подходы к диагностике ТБ и МЛУ-ТБ, а также биомаркеры ответа на лечение - последние данные о регистрации на июль 2020 г.

Анализировать взаимосвязь между лекарственными вариантами в геноме туберкулеза и соответствующей восприимчивостью к лекарственным средствам in vitro для разработки инструмента поддержки принятия решений для выбора терапии второй линии в случае подозрения на МЛУ-ТБ. 

Базы данных

Когорта с диагнозом туберкулез

База данных основана на существующей когорте биомаркеров ТБ, многоцентровой когорте длительного лечения МЛУ-ТБ с анализом крови / плазмы и мочи с течением времени. Когорта содержит образцы пациентов, взятых в момент времени 0 (т.е. до лечения) и до тех пор, пока лечение не было завершено (или не удалось). После пилотного анализа с использованием подхода глобального профилирования 600 мкл плазмы подвергают 1H-ЯМР и 3-кратному нецелевому анализу UPLS-масс-спектрометрии; Дальнейший пилотный анализ проводится с использованием соответствующих образцов мочи. Цель - найти биомаркеры для раннего выявления МЛУ-ТБ. Новые особенности были обнаружены и описаны в нашем недавнем анализе существующей подгруппы из 48 образцов мочи, которые, по-видимому, эффективны для отличия туберкулеза от контрольной группы. Следующим шагом является проведение анализа «доказательства принципа» для субкогорт из России и Литвы. Анализ биомаркеров Initila Plasma в когорте образцов пациентов (242) выявил особенности, которые, как было обнаружено, по-разному менялись во времени в случаях DS и MDR в течение первых 6 месяцев лечения. Из 40 маркеров, описанных в литературе, можно было найти по крайней мере одну функцию соответствия в анализах набора данных плазмы TB H2020 для 24. Нецелевой и целенаправленный подход используется для определения специфических для микобактерий липидов в образцах мочи как для быстрой диагностики ТБ, так и для прогноза. . Основные цели исследования включают концентрацию липидов в образцах мочи больных туберкулезом и выявление липидных сигнатур туберкулеза на фоне липидов человека в образцах от пациентов; сконцентрировать образцы трансренальной ДНК ТБ и определить другие подходящие биомаркеры; собрать образцы мокроты и мочи у 150 больных туберкулезом и больных туберкулезом; завершить слепую оценку липидомных подходов ТБ и определения концентрации ДНК; применить оптимизированные условия для концентрации и амплификации ДНК ТБ к объемам мочи от 1 до 10 мл от пациентов из существующих когорт с подтвержденным легочным ТБ по сравнению со здоровой мочой добровольцев и образцами от пациентов с бактериальным пиелонефритом. Данные БД поступают из центров в России и Литве.

Когорта TB SIGLEC-1

Гипотеза исследования состоит в том, что сильная связь между внелегочной диссеминированной формой ТБ и присутствием нулевого аллеля Siglec-1, наблюдаемая в швейцарской когорте ВИЧ-1 и подтвержденная в других когортах, связана с опосредованным экзосомами иммунитетом на ранней стадии после заражения MTB, что приведет к быть скомпрометированным в отсутствие Siglec-1, который необходим для захвата экзосом APC, как было продемонстрировано ранее.
Для подтверждения гипотезы в исследовании сначала была разработана небольшая когорта пациентов с внелегочным туберкулезом (15-30) с сопутствующим ВИЧ и без него в России, параллельно с аналогичной когортой, разработанной в Испании; затем он оценивает ключевые полиморфизмы с помощью анализа на основе ПЦР, ранее разработанного для пациентов с легочным туберкулезом. Данные БД поступают из центров в России.

Этот проект получил финансирование от исследовательской и инновационной программы Horizon 2020 Европейского Союза в рамках грантового соглашения № 825673.

КОНТАКТЫ

Francesca Incardona

 

f.incardona@euresist.org