Новые подходы к диагностике туберкулеза (ТБ) и туберкулеза с множественной лекарственной устойчивостью (МЛУ-ТБ) и биомаркеры ответа на лечение

Ведущая партнерская организация: Imperial College (Великобритания)

Туберкулез (ТБ) вызывает 10,4 миллиона новых случаев заболевания во всем мире. В целях комплексного улучшения клинического и эпидемиологического контроля за туберкулезом, особенно в восточноевропейских регионах, CARE будет сосредоточена на:

  • Идентификация биомаркеров лекарственно-чувствительного и МЛУ-ТБ и связь с неудачей / излечением лечения путем анализа крови / плазмы и мочи в когорте длительного наблюдения

  • Разработка неинвазивной ранней диагностики туберкулеза и определение прогностических маркеров на основе анализа мочи.

  • Определение новых биомаркеров прогрессирования или излечения заболевания туберкулезом, особенно в контексте мультирезистентного туберкулеза (МЛУ-ТБ).

  • Изучение роли SIGLEC 1 в туберкулезе путем выявления и анализа полиморфизмов в когорте пациентов с внелегочным туберкулезом.

Текущие результаты

Heading 1

Heading 1

Мы определили и дополнительно оценили по крайней мере 2 кандидата в биомаркеры реакции на лечение в моче.

Мы проанализировали образцы плазмы и мочи, взятые через регулярные промежутки времени из более ранней продольной когорты пациентов с чувствительной (DSTB) и множественной лекарственной устойчивостью (MDRTB) из России и Литвы, и создали базу данных TB H2020. Используя линейные смешанные модели для продольного анализа, мы идентифицировали метаболиты, количество которых изменяется в ответ на лечение туберкулеза.

После применения этой процедуры ко всем метаболическим сигналам в анализе мы выбрали ряд статистически значимых характеристик (порог p-значений установлен на 5% для учета ложного обнаружения), показанных в таблице 1. Некоторые сигнатуры довольно большие (например, нецелевой набор данных XCMS RPOS содержит> 100 функций, прошедших коррекцию ложной скорости обнаружения).

Heading 1

Таблица 1 - Количество характеристик в каждом анализе, для которых тенденция со временем оказалась значимой

Все это возможные биомаркеры действия противотуберкулезных препаратов.
Некоторые из возможных маркеров, которые мы идентифицировали, были обнаружены в диагностическом исследовании Isa et al (Isa, F. et al. Mass Spectrometric Identification of Urinary Biomarkers of Pulmonary Tuberculosis. EBioMedicine 31, 157–165 (2018)), и мы оценили их изменения во времени во время лечения ТБ в исходном справочнике. В таблице 2 обобщены результаты такого продольного анализа в нашем наборе данных TB H2020, что указывает на потенциальную ценность при определении излечения.

Таблица 2 - Результаты набора данных TB H2020 анализа продольной репликации маркеров, представленных Isa et al.

В случае успеха это исследование внесет вклад в разработку надежных неинвазивных средств диагностики туберкулеза.

Этот проект получил финансирование от исследовательской и инновационной программы Horizon 2020 Европейского Союза в рамках грантового соглашения № 825673.

КОНТАКТЫ

Francesca Incardona

 

f.incardona@euresist.org