Молекулярная эпидемиология ВИЧ и новые стратегии лечения в России и Восточной Европе

LВедущая партнерская организация: Karolinska Institute (Швеция)

Принимая комплексный подход к лечению ВИЧ-инфекции, CARE, с одной стороны, проанализирует молекулярную эпидемиологию инфекции, включая эффективность лечения и лекарственную устойчивость; с другой стороны, он будет готовиться к введению лечения на основе долутегравира, как это рекомендовано Всемирной организацией здравоохранения. 
CARE будет преследовать следующие конкретные цели: 

  • Характеристика кластеров передачи ВИЧ с различными подтипами и рекомбинантами, включая молекулярную эпидемиологию коинфекции ВИЧ / ТБ в Европе и Российской Федерации. 

  • Разработка протоколов высокопроизводительного секвенирования (HTS) на основе секвенирования следующего поколения для мониторинга лекарственной устойчивости ВИЧ в удобном и продуктивном формате. 

  • Анализ механизмов лекарственной устойчивости INSTI (ингибитора переноса интегразы) в широко распространенном подтипе ВИЧ-1 A6, включая роль естественных полиморфизмов и нецелевых механизмов, основанных на мутациях вне гена интегразы 

  • Сравнительный анализ временных тенденций первичной лекарственной устойчивости (ПДР) в России и оценка ее влияния на предстоящую терапию на основе долутегравира на основе имеющихся в настоящее время данных и специальной программы эпиднадзора за ПДР. 

  • Анализ побочных эффектов, переносимости и эффективности лечения DTG, включая оценку лекарственной устойчивости к ВИЧ, в большой группе пациентов из Европы и России, включая пациентов с моноинфекцией ВИЧ и с коинфекцией ВИЧ / ТБ.

Текущие результаты

Heading 1

Heading 1

Heading 1

Консорциум CARE добился важных научных успехов в экспериментальных исследованиях и создании когорт для оценки лекарственной устойчивости к ингибиторам интегразы (INSTI).

Кроме того, он получил знания о влиянии естественных полиморфизмов, ранее существовавших и нецелевых мутаций на восприимчивость к INSTI в ограниченном количестве изолятов ВИЧ от пациентов, инфицированных подтипами / подтипами, широко распространенными в России и Восточной Европе, но редко в остальном. .

  • Создана Восточноевропейская база данных для молекулярного эпидемиологического анализа ВИЧ-1 с целью охвата 1100 пациентов в России, Грузии и Украине. На данный момент включены 1620 ретроспективных последовательностей и 859 предполагаемых пациентов, а проспективные образцы и сбор данных продолжаются.

  • Последовательности домашней интегразы дикого типа ВИЧ + подтипа A6 были получены из Европы, России и Грузии, и была создана новая консенсусная последовательность A6.

  • Образцы пациентов с вирусом А6, инфицированным ВИЧ-1, были отправлены из России и Украины в Европу, и началось создание рекомбинантных вирусов А6.

  • Высокопроизводительный метод секвенирования для штаммов ВИЧ-1 A6 был разработан и проверен на шведских, немецких и российских образцах.

  • Подтип A6 был проанализирован на предмет его фенотипической чувствительности in vitro к ингибиторам переноса цепи интегразы (INSTI). Кодирующая область интегразы ВИЧ-1 из двадцати различных изолятов А6 была вставлена ​​в основную цепь NL4-3 ВИЧ-1 и оказалась такой же чувствительной, как интеграза эталонного подтипа B к INSTI, включая долутегравир, биктегравир, каботегравир. Хотя эти данные обнадеживают, продолжается дальнейший анализ для оценки генетического барьера изолятов A6 для INSTI посредством экспериментов по отбору лекарственной устойчивости in vitro.

  • При повторном анализе шведской базы данных InfCareHIV (> 11.000) пациенты, инфицированные штаммом A6, были впервые идентифицированы с первым случаем в 1991 году и значительным увеличением числа в период 2007-2020 годов.

  • В рамках проспективного субисследования лекарственной устойчивости ВИЧ собираются реальные образцы пациентов, потерпевших неудачу (целевой показатель - 160) из России и Украины. По состоянию на октябрь 2020 года было собрано 208 образцов от пациентов, не прошедших INSTI.

Этот проект получил финансирование от исследовательской и инновационной программы Horizon 2020 Европейского Союза в рамках грантового соглашения № 825673.

КОНТАКТЫ

Francesca Incardona

 

f.incardona@euresist.org